Aunque está casi recién estrenado, el Tren Maya volvió a reportar una falla el pasado lunes 25 de marzo de 2024, ya que se descarriló un vagón del tren D006, lo que interrumpió el flujo sobre la vía. También se vio afectado el viaje de varias personas. Por el momento, el Tren Maya investiga el caso y afirmaron que no se reportaron víctimas que lamentar ni pérdidas materiales.

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